Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Сочинский научно-исследовательский центр Российской академии наук (СНИЦ РАН) создано в соответствии с Решением Президиума Академии наук СССР и Государственного комитета СССР по народному образованию от 15 декабря 1988 года № 202/538. Первоначальное его название – Научно-исследовательский центр «Управление развитием рекреационных территорий и туризма» Академии наук СССР в г. Сочи. В последствии оно несколько изменялось.

В 2007 г. в соответствии с постановлением Президиума Российской академии наук от 18 декабря 2007 г. № 274 организация была переименована в Учреждение Российской академии наук Сочинский научно-исследовательский центр РАН. Постановлением Президиума РАН от 13 декабря 2011 г. № 262 изменен тип и наименование Центра с Учреждения Российской академии наук Сочинского научно-исследовательского центра РАН на Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Сочинский научно-исследовательский центр Российской академии наук. В соответствии с Федеральным законом от 27 сентября 2013 г. № 253-ФЗ «О Российской академии наук, реорганизации государственных академий наук и внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации» и распоряжением Правительства РФ от 30 декабря 2013 г. № 2591-р Центр передан в ведение Федерального агентства научных организаций (ФАНО России). В соответствии с Постановлением Правительства РФ от 15.06.2018 № 682 «Об утверждении Положения о Министерстве науки и высшего образования Российской Федерации и признании утратившими силу некоторых актов Правительства Российской Федерации» Центр передан в ведение Министерства науки и высшего образования Российской Федерации.